隨著北醫醫療體系擴張,本中心於2011年成立醫務行政組,負責附屬醫院之各項專案規劃與執行追蹤、危機事件協調、擬訂行政管理相關制度與醫師人才人員培訓、統籌內部控制制度與稽核規章,另擔任各組協調與各項庶務運作之角色。

        依業務功能,本中心另有設置九大機能小組,其中人力發展小組、醫品醫務小組及護理小組由醫務行政組負責運作與推動,以達校院溝通整合,使校院經營理念一致。

        未來將持續配合學校政策,協助整合附設醫院、萬芳醫院與雙和醫院之醫院評鑑事宜,另因應政府政策(如勞基法、醫學制度改革等),研擬因應措施並持續完善附屬醫院相關制度。